Amplification test and selection of markers analogue to resistance genes in species and commercial varieties of Passiflora spp.
DOI:
https://doi.org/10.33837/msj.v3i1.1183Palabras clave:
Passion fruit, Selection, RGA, Genetic enhancement.Resumen
Brazil is highlighted as the largest producer and consumer of passion fruit (Passiflora) and holder of representative biodiversity. Studies dedicated to the genetic characterization of the genus in order to understand the existing diversity are important for the advancement of genetic improvement and conservation programs. The aim of this study was to select combinations of RGA (Resistance Genes Analogs) primers for commercial passion fruit species and varieties. To this end, amplification tests were performed on a PCR platform in 17 combinations of RGA primers for eight species and 12 commercial varieties of passion fruit from the Banco Ativo de Germoplasma Flor da Paixão. All combinations of primers have generated amplification products in at least one of the Passiflora samples. The number of combinations that generated amplification products varied from seven to 12 in the species and from three to eight in the varieties. Three to 12 combinations generated amplification products for the samples, emphasizing that the RGA markers were efficient in accessing genomic loci in the species and varieties of passion fruit. The variation of efficient combinations in each of the species and varieties attested to the importance of this research in the preliminary stages of genetic studies as auxiliary tools in conservation and genetic improvement programs. However, this study made it possible to identify combinations of primers to be prioritized in inter and intraspecific genetic characterizations of passion fruit.
Citas
Amaral, D. O. J., Araújo, D. R. C., Freitas, J. G., Batista, F. R. C (2019). Seleção de primers polimórficos para estudo de diversidade genética em cactaceas. Multi-ScienceJournal, 2(3), 9-13.
Barbosa, N. C. S. (2016). Anatomia foliar e diversidade genética em Passiflora spp. (Passifloraceae l.) resistentes ao cowpeaaphid-borne mosaicvirus (CABMV). (Dissertação de mestrado). Universidade Federal da Bahia, Brasil.
Bellon, G., Faleiro, F. G., Junqueira, K. P., Junqueira, N. T. V., Santos, E. C., Braga, M. F., Guimarães, C. T. (2007). Variabilidade genética de acessos silvestres e comerciais de Passiflora edulissims. com base em marcadores RAPD. RevistaBrasileira de Fruticultura. 29(1), 124-127.
Bent, A. F. (1996). Plant Disease Resistance Genes: Function Meets Structure. Plant Cell, Rockville, 8(10), 1757-1771.
Bernacci, L. C., Cervi, A. C., Milward-De-Azevedo, M. A., Nunes, T. S., Imig, D. C., Mezzonato, A. C. (2016). Passifloraceae. In: lista de espécies da flora do Brasil. Jardim Botânico do Rio de Janeiro. Disponível em: <http://reflora.jbrj.gov.br/jabot/floradobrasil/FB12534> Acesso em: 13/02/2017.
Borém, A., Miranda, G. V. (2005). Marcadores Moleculares. In: Melhoramento de Plantas. (4º Ed.). (pp. 441-463). Viçosa: UFV.
Castro, J. A. (2012). Conservação dos recursos genéticos de Passiflora e seleção de descritores mínimos para caracterização de maracujazeiro. (Dissertação de Mestrado). Universidade Federal do Recôncavo Da Bahia, Brasil.
Cerqueira-Silva, C. B. M., Faleiro, F. G., Jesus, O. N., Santos, E. S. L., Souza, A. P. (2018). Passion Fruit (Passiflora spp.) Breeding. In: Al-Khayri, J., Jain, S., Johnson, D. (1º Ed.). Advances in Plant Breeding Strategies: Fruits. Springer.
Cerqueira-Silva, C. B. M, Faleiro, F. G., Nunes, O., Santos, E. S. L., Souza, A. P. (2015). The Genetic Diversity, Conservation, and Use of Passion Fruit (Passiflora spp.). Switzerland: Springer InternationalPublishing, 8, 215-231.
Cerqueira-Silva, C. B. M., Jesus, O. N., Santos, E. S. L., Corrêa, R. X., Souza, A. P. (2014). Genetic Breeding and Diversity of the Genus Passiflora: Progress and Perspectives in Molecular and Genetic Studies. Int. J. Mol. Sci. 15, 14122-14152.
Cervi, A. C., Imig, D. C. (2013). A new species of Passiflora (passifloraceae) from. Mato Grosso do Sul, Brasil. Phytotaxa, 103(1), 46-50
Costa, A. M., Tupinambá, D. D. (2005). O maracujá e suas propriedades medicinais- estado da arte. In: Faleiro, F. G., Junqueira, N. T. V., Braga, M. F. (Eds.) Maracujá: germoplasma e melhoramento genético. (pp. 475-508). Planaltina: Embrapa Cerrados.
Costa, J. L., Oliveira, E. J., Jesus, O. N. De, Oliveira, G. A. F., Neves, C. G., Castro, J. A. (2010). Estudo de diversidade genética em Passiflora edulissims com o uso de marcadores ISSR. In: Congresso Brasileiro de Fruticultura, 17-22 Outubro de 2010, Natal, RN (pp. 1-5). Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura.
Cunha, M. A. P., Barbosa, L. V., Faria, G. A. (2004). Botânica. In: Lima, A. De A.; Cunha, M. A. P. Maracujá: Produção e qualidade na passicultura. (pp. 13-36). Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura.
Faleiro, F. G., Amabile, R. F., Silva, C. B. M. C. (2018). Marcadores Moleculares Aplicados ao Melhoramento Genético de Plantas. In: Amabile, R. F., Vilela, M. S., Peixoto, J. R. (1º Ed). Melhoramento de plantas: variabilidade genética, ferramentas e mercado. (pp. 53-76). Brasília: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas.
Faleiro, F. G., Junqueira, N. T. V., Braga, M. F., Peixoto, J, R. (2011). Pré-melhoramento do maracujá. In: Lopes, M. A., Fávero, A. P., Ferreira, M. A. J. F., Faleiro, F. G., Folle, S. M., Guimarães, E. P. (Eds). Pré-melhoramento de plantas. Estado da arte e experiências de sucesso. (pp 549–570). Brasília: Embrapa Informações Tecnológicas.
Faleiro, F. G., Junqueira, N. T. V., Braga, M. F., Oliveira, E. J., Peixoto, J. R., Costa, A. M. (2011). Germoplasma e melhoramento genético do maracujazeiro: histórico e perspectivas. (pp. 10-18). Planaltina: Embrapa Cerrados.
Faleiro, F. G., Junqueira, N. T. V., Braga, M. F., Peixoto, J. R. (2008). Caracterização de germoplasma e melhoramento genético do maracujazeiro assistidos por marcadores moleculares: resultados de pesquisa 2005-2008. (pp. 59). Planaltina: Embrapa Cerrados. (Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, Nº 207).
Faleiro, F. G., Junqueira, N. T. V., Braga, M. F. (2006). Maracujá: demandas para a pesquisa. (pp. 54). Planaltina, DF: Embrapa Cerrados.
Faleiro, F. G., Faleiro, A. S. G., Cordeiro, M. C. R., Karia, C. T. (2003). Metodologia para operacionalizar a extração de DNA de espécies nativas do cerrado. (pp. 1-5). Planaltina: Embrapa Cerrados.
Gonçalves, J. S., Souza, S. A. M. (2006). Fruta da paixão: panorama econômico do maracujá no Brasil. Informações Econômicas, São Paulo, 36(12), 29-35.
Hammond-Kosack, K. E., Jones, J. D. G. (1997). Plant Disease Resistance Genes. Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology, 48, 575-607.
Jesus, O. N., Machado, C. F., Soares, T. L., Junghans, T. G., Oliveira, E.J.,Faleiro, F. G. (2013). Recursos genéticos de Passiflora na Embrapa Mandioca e Fruticultura. In: Congreso Latinoamericano de Passifloras, Neiva, Huila, Colombia, 20-22 novembro de 2013 (pp. 24-35). Libro de Memorias. Neiva: CEPASS HUILA.
Junqueira, N. T. V., Braga, M. F., Faleiro, F. G., Peixoto, J. R., Bernacci, L. C. (2005). Potencial de espécies silvestres de maracujazeiro como fonte de resistência a doenças. In: Faleiro, F. G., Junqueira, N. T. V., Braga, M. F. (Eds.). Maracujá: germoplasma e melhoramento genético. (pp. 81-107) Planaltina: Embrapa Cerrados.
Kanazin, V., Frederick, M. L., Shoemaker, R. C. (1996). Resistance Gene Analogs are Conserved and Clustered in Soybean. Proceedings of the National Academy of Sciences of the U S A, 93, 11746-11750.
Leister, D., Ballvora, A., Salamini, F. E., Gebhardt, C. A. (1996). A PCR-based approach for isolating pathogen resistance genes from potato with potential for wide application in plants. NatureGenetics, 14, 421-429.
Maciel, C. C. (2014). Diversidade de genótipos de melão por meio de descritores morfológicos e marcador RGA. (Dissertação de Mestrado). Universidade Estadual de Santa Cruz, Brasil.
Meletti, L. M. M., Soares-Scott, M. D., Bernacci, L. C., Passos, I. R. S. (2005). Melhoramento genético do maracujá: passado e futuro. In: Faleiro, F. G., Junqueira, N. T. V., Braga, M. F. Maracujá: Germoplasma E MelhoramentoGenético. (pp. 55-78). Planaltina: Embrapa Cerrados.
Nass, L. L. (2011). Pré-melhoramento vegetal. In: Lopes, M. A., Fávero, A. P., Ferreira, M. A. J. F., Faleiro, F. G., Folle, S. M., Guimarães, E. P. (Eds). Pré-melhoramento de plantas. (pp. 23-38). Brasília: Embrapa Informações Tecnológicas.
Paula, S. M., Fonseca, M. E. N., Boiteux, L. S., Peixoto, J. R. (2010). Caracterização genética de espécies de Passiflora por marcadores moleculares análogos a genes de resistência. Revista Brasileira de Fruticultura, 32(1), 222-229.
Pereira, A. S. (2012). Genética e pós-melhoramento em variedades de maracujazeiro amarelo: variabilidade acessada por ferramentas biométricas e moleculares. (Dissertação De Mestrado). Universidade Estadual Santa Cruz, Brasil.
Pereira, D. A., Corrêa, R. X., Oliveira, A. C. (2015). Molecular genetic diversity and differentiation of populations of ‘somnus’ passion fruit trees (Passiflorasetacea DC): Implications for conservation and pre-breeding. BiochemicalSystematics e Ecolog, 59, 12-22.
Pinheiro, L. R., Rabbani, A. R. C., Silva, A. V. C, Ledo, A. S., Pereira, K. L. G., Diniz, L. E. C. (2012). Genetic diversity and population structure in the Brazilian cattleyalabiata(orchidaceae) using RAPD and ISSR markers. Plant System aticsand Evolution, 12, 1815-1828.
Silva, T. S. S., Freitas, J. S., Dos Santos, E. S. L., Cardoso, T. Dos. S., Cerqueira-Silva, C. B. M. (2018). Caracterização e seleção de marcadores moleculares em Crotonlinearifolius.Mull. Arg. Como subsídio para estudos genéticos. Multi-ScienceJournal, 1(10), 4-8.
Sousa, A. G. R., Souza, M. M., Melo, C. A. F., Sodré, G. A. (2015). ISSR markers in wild species of Passiflora l. (passifloraceae) as a tool for taxon selection in ornamental breeding. Genetics And Molecular Research, 14(4), 18534-18545
Viana, A. P., Pereira, T. N. S., Pereira, M. G., Souza, M. M., Aldonado, J. F. M., Amaral Jr, A. T. (2003). Genetic diversity among yellow passion fruit comercial76 genotypes and among passiflora species using RAPD. Revista Brasileira de Fruticultura, 25(3), 489-493.
Vieira, A. C., Cardoso, T. dos S., Silva, T. S. S., Cerqueira-Silva, C. B. M., Santos, E. S. L. (2019). Seleção de primers Inter SimpleSequenceRepeat em melocactusconoideusbuin. &bred. (cactaceae), espécie endêmica do sudoeste da Bahia, Brasil. Enciclopédia biosfera, 16(29), 1365-1374.
Yu, Y. G., Buss, G. R., SaghaiMaroof, M. A. (1996). Isolation of a Super Family of Candidate Disease-Resistance Genes in Soybean Based on a Conserved Nucleotide-Binding Site. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, 93, 11751-11756.
Zeraik, M. L. (2010). Estudo analítico dos flavonoides dos frutos do maracujá (Passiflora edulis sims f. flavicarpa Degener). (Tese de Doutorado). Universidade de São Paulo, Brasil.
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