Amplification test and selection of markers analogue to resistance genes in species and commercial varieties of Passiflora spp.

Authors

  • Larissa Neres Barbosa de Souza Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia
  • Nátilla Deyse Souza Costa Dias Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia
  • Vandrick de Oliveira Santana Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia
  • Lucas Amorim Silveira Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia
  • Messulan Rodrigues Meira Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia
  • Elisa Susilene Lisboa Santos Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia
  • Fábio Gelape Faleiro EMBRAPA Cerrados
  • Carlos Bernard Moreno Cerqueira-Silva Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia. http://orcid.org/0000-0002-1883-4543

DOI:

https://doi.org/10.33837/msj.v3i1.1183

Keywords:

Passion fruit, Selection, RGA, Genetic enhancement.

Abstract

Brazil is highlighted as the largest producer and consumer of passion fruit (Passiflora) and holder of representative biodiversity. Studies dedicated to the genetic characterization of the genus in order to understand the existing diversity are important for the advancement of genetic improvement and conservation programs. The aim of this study was to select combinations of RGA (Resistance Genes Analogs) primers for commercial passion fruit species and varieties. To this end, amplification tests were performed on a PCR platform in 17 combinations of RGA primers for eight species and 12 commercial varieties of passion fruit from the Banco Ativo de Germoplasma Flor da Paixão. All combinations of primers have generated amplification products in at least one of the Passiflora samples. The number of combinations that generated amplification products varied from seven to 12 in the species and from three to eight in the varieties. Three to 12 combinations generated amplification products for the samples, emphasizing that the RGA markers were efficient in accessing genomic loci in the species and varieties of passion fruit. The variation of efficient combinations in each of the species and varieties attested to the importance of this research in the preliminary stages of genetic studies as auxiliary tools in conservation and genetic improvement programs. However, this study made it possible to identify combinations of primers to be prioritized in inter and intraspecific genetic characterizations of passion fruit.

Author Biographies

Larissa Neres Barbosa de Souza, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Biologa pela Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia e Mestre em Ciências Ambientais pelo PPGCA/UESB

Nátilla Deyse Souza Costa Dias, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Biologa pela Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia e Mestre em Ciências Ambientais pelo PPGCA/UESB

Vandrick de Oliveira Santana, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Biologo pela Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia e Mestrando em Ciências Ambientais pelo PPGCA/UESB

Lucas Amorim Silveira, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Mestre e Doutorando em Bioquimica e Biologia Molecular pela Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Messulan Rodrigues Meira, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Pós Doc no Programa de Ciências Ambientais - PPGCA da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Elisa Susilene Lisboa Santos, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Profa. do Departamento de Ciências Exatas e Naturais da UESB. Doutora em Genética e Biologia Molecular pela UNICAMP. Professora Permanente dos Programas de Pós Graduação em Ciências Ambientais (PPGCA) e Bioquimica e Biologia Molecular (PMBqBM).

Fábio Gelape Faleiro, EMBRAPA Cerrados

Pesquisador Dr. da EMBRAPA Cerrados.

Melhorista de Plantas, especialista em melhoramento Genético de Maracujazeiros (Passiflora spp)

Carlos Bernard Moreno Cerqueira-Silva, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

Biólogo pela Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia - UESB, especialista (Latu-sensu) em Genética, pela Faculdade Católica de Ciências Econômicas da Bahia - FACCEBA, Mestre e Doutor em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Estadual de Santa Cruz - UESC e Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, respectivamente. Atualmente é Professor Assistente 'B' (com 'D.E.') da UESB, atuando como Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais (PPG-CA/UESB, Mestrado), Professor Permanente do Programa de Pós-Graduação em Zootecnia (PPZ/UESB, Mestrado/Doutorado) e Coordenador da Área de Biologia Geral e Aplicada do DCEN/UESB, sendo também colaborador na orientação de estudantes em programas de Pós-Graduação da UFRB/EMBRAPA.. Na graduação é responsável pelas disciplinas de Genética Geral, Biologia Molecular e Biologia Evolutiva para os cursos de Ciências Biológicas e Zootecnia. Na Pós-Graduação é responsável pela disciplina de Genética Molecular Aplicada à Conservação e Melhoramento ao Melhoramento. Desenvolve suas atividades de pesquisa nos laboratórios de Genética Molecular Aplicada (LGMA/UESB), Centro de Biotecnologia e Genética (CBG/UESC) e Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG/UNICAMP). Participou de 55 eventos científicos, tendo recebido 16 prêmios e/ou homenagens. Possui 35 Artigos e 116 resumos (publicados ou aceito para publicação). Atua na área de Genética vegetal e Biologia Molecular, com ênfase em Diversidade Genética, Genética de Populações e Pré-Melhoramento de plantas, sendo revisor de 8 periódicos nacionais e internacionais. Participa atualmente de 4 projetos de pesquisa (já tendo colaborado em outros 17 projetos).

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Published

2020-09-01

How to Cite

Souza, L. N. B. de, Dias, N. D. S. C., Santana, V. de O., Silveira, L. A., Meira, M. R., Santos, E. S. L., Faleiro, F. G., & Cerqueira-Silva, C. B. M. (2020). Amplification test and selection of markers analogue to resistance genes in species and commercial varieties of Passiflora spp. Multi-Science Journal, 3(1), 65–71. https://doi.org/10.33837/msj.v3i1.1183

Issue

Vol. 3 No. 1 (2020)

Section

Agricultural Sciences

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