Caracterização de marcadores microssatélites em plantas nativas do Cerrado brasileiro

Auteurs

  • Nábia Gonçalves Camargo
  • Orlando José da Silva Gontijo
  • Ana Clara de Oliveira Ferraz Barbosa Instituto Federal Goiano - Câmpus Urutaí

DOI :

https://doi.org/10.33837/msj.v1i6.116

Résumé

O Cerrado é o um dos biomas que apresenta a mais rica flora dentre as savanas do mundo e possui um alto índice de endemismo. No entanto, ainda há pouco conhecimento acerca destas espécies. Com a modernização e avanços das técnicas da Genética e da Biologia Molecular surgiram diversos tipos marcadores moleculares que detectam o polimorfismo genético diretamente no DNA. Dentre os diferentes tipos de marcadores os microssatélites se destacam por serem altamente polimórficos. Essas sequências apresentam elevada taxa de mutação, sendo altamente informativas e apresentando elevado potencial de utilização em programas de melhoramento de plantas, na construção de mapas genéticos, na identificação de indivíduos, entre outras aplicações. O presente trabalho teve como objeto caracterizar marcadores microssatélites no genoma de plantas nativas do Cerrado brasileiro, depositadas em bancos de dados de DNA. O estudo foi realizado por meio da obtenção de sequências do DNA de vinte plantas, em seguida foi feita a busca e a caracterização de microssatélites no genoma dessas plantas e o desenho de primers que flanqueiam os marcadores encontrados. Foram localizados 123 microssatélites, sendo 38 mononucleotídeos, 79 dinucleotídeos, 5 trinucleotídeos e 1 tetranucleotídeo.

Biographie de l'auteur

Ana Clara de Oliveira Ferraz Barbosa, Instituto Federal Goiano - Câmpus Urutaí

É bacharel e licenciada em Ciências Biológicas (Biologia) pela Universidade de Brasília - UnB (2003). É mestre em Biologia (Área de Concentração: Biologia Celular e
Molecular) pela Universidade Federal de Goiás - UFG (2010) e doutora em Genética e Melhoramento de Plantas pela Universidade Federal de Goiás (2014). É integrante do
projeto de pesquisa "GENPAC 02 - Desenvolvimento de marcadores, genotipagem e caracterização genômica de espécies do Cerrado". Tem experiência em Genética, com
ênfase em genética e genômica de plantas nativas do Cerrado brasileiro, atuando principalmente nos seguintes temas: marcadores moleculares, genotipagem, multiplex de
PCR, genética de populações, estrutura populacional e sistema de cruzamento e bioinformática. Atualmente é professora do Instituto Federal Goiano - Câmpus Urutaí, Núcleo das Ciências Biológicas.

Références

Attwood, T. K., Gisel, A., Eriksson, N. E., & Bongcam-Rudloff, E. (2011). Concepts, historical milestones and the central place of bioinformatics in modern biology: a European perspective. Bioinformatics - Trends and Methodologies, 3-38.

Avidos, M. F. D., & Ferreira, L. T. (2000). Frutos dos Cerrados. Biotecnologia, Ciência e Desenvolvimento, 3(15), 36-41.

Brondani, R. P. V., Brondani, C., Tarchini, R., & Grattapaglia, D. (1998). Development, characterization and mapping of microsatellite markers in Eucalyptus grandis and E. urophylla. Theoretical and Applied Genetics, 97(5-6), 816-827.

Byrne, M., Marquezgarcia, M. I., Uren, T., Smith, D. S., & Moran, G. F. (1996). Conservation and genetic diversity of microsatellite loci in the genus Eucalyptus. Australian Journal of Botany, 44(3), 331-341.

FALEIRO, F. G. (2007). Marcadores genético-moleculares aplicados a programas de conservação e uso de recursos genéticos. Planaltina: Embrapa Cerrados.

Faleiro, F. G., & Farias Neto, A. L. (2008). Savanas: desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais. Planaltina: Embrapa Cerrados.

Forzza, R. C., Baumgratz, J. F. A., Bicudo, C. E. M., Canhos, D. A. L., Carvalho, A. A., Coelho, M. A. N., et al. (2012). New Brazilian floristic list highlights conservation challenges. BioScience, 62(1), 39-45.

Goldstein, D. B., & Schlotterer, C. (1999). Microsatellites: evolution and applications (1 ed.). Oxford: Oxford University Press.

Martins, W. S., Lucas, D. C. S., Neves, K. F. S., & Bertioli, D. J. (2009). WebSat - A web software for microsatellite marker development. Bioinformation, 3(6), 282-283.

Myers, N., Mittermeier, R. A., Mittermeier, C. G., Da Fonseca, G. A. B., & Kent, J. (2000). Biodiversity hotspots for conservation priorities. Nature, 403(6772), 853-858.

Prosdocimi, F., Coutinho, G., Ninnecw, E., Silva, A. F., Reis, A. N., Martins, A. C., et al. (2002). Bioinformática: manual do usuário. Biotecnologia Ciência & Desenvolvimento, 29, 12-25.

Téléchargements

Publiée

2017-07-24

Comment citer

Camargo, N. G., da Silva Gontijo, O. J., & Barbosa, A. C. de O. F. (2017). Caracterização de marcadores microssatélites em plantas nativas do Cerrado brasileiro. Multi-Science Journal, 1(6), 41–47. https://doi.org/10.33837/msj.v1i6.116

Numéro

Vol. 1 No 6 (2016)

Rubrique

Technical Communications

Licence

Authors who publish in this journal agree to the following terms:

a)      The Authors retain the copyright and grant the journal the right to first publication, with the work simultaneously licensed under the Creative Commons Attribution License that allows the sharing of the work with acknowledgment of authorship and initial publication in this journal.

b)     Authors are authorized to assume additional contracts separately, for non-exclusive distribution of the version of the work published in this journal (eg, publishing in institutional repository or as a book chapter), with acknowledgment of authorship and initial publication in this journal.

c)      Authors are allowed and encouraged to publish and distribute their work online (eg in institutional repositories or on their personal page) at any point before or during the editorial process, as this can generate productive changes, as well as increase impact and citation of the published work.